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11 Marzo 2020
  • Multiscale approach to electron transport dynamics
    J. Chem. Phys. 151, 084105 (2019)
  • Ligand Binding Rate Constants in Heme Proteins Using Markov State Models and Molecular Dynamics Simulations.
    ChemPhysChem 2019, 20, 2451.
  • Reaction Path Analysis from Potential Energy Contributions Using Forces: An Accessible Estimator of Reaction Coordinate Adequacy.
    https://doi.org/10.1021/acs.jctc.9b01081
  • A computational investigation of the reactions of tyrosyl, tryptophanyl, and cysteinyl radicals with nitric oxide and molecular oxygen
    Free Radical Research, 53:1, 18-25

Recursos

LOGAN cuenta con recursos para realizar calculos en placas GPU y en multiples procesadores, a continuacion se detalla el hardware con el que cuenta nuestro cluster.

1080 queue (3 nodos)

compute-0-0

CPU: Intel(R) Core(TM) i3-2120 (4 procesadores)
GPU(1): GeForce GTX 1080

compute-0-29 a 0-30

CPU: Intel(R) Core(TM) i5-7400 (4 procesadores)
GPU(1): GeForce GTX 1080
GPU(1): GeForce GTX 980 Ti

ALL queue (5 nodos)

compute-0-28

CPU: Intel(R) Core(TM) i5-4440 (4 procesadores)
GPU(2): GeForce GTX 980

compute-0-3

CPU: Intel(R) Core(TM) i7-950 (8 procesadores)
GPU(2): GeForce GTX 980

compute-0-4 a 0-5

CPU: Intel(R) Core(TM) i5-2310 (4 procesadores)
GPU(2): GeForce GTX 980

compute-0-6

CPU: Intel(R) Core(TM) i5-3450 (4 procesadores)
GPU(1): GeForce GTX 980

CPU queue (14 nodos)

compute-0-13 a 0-26

CPU: Intel(R) Xeon(R) CPU E5620 (8 procesadores)

OTRAS queue (2 nodos)

compute-0-1

CPU: Intel(R) Core(TM) i3-2120 (4 procesadores)
GPU(1): GeForce GTX 580

compute-0-7

CPU: Intel(R) Core(TM) i3-2120 (4 procesadores)
GPU(1): GeForce GTX 680